Trong giai đoạn 1999-2009, Trường Đại học Hà Nội (trước đây là Trường Đại học Ngoại ngữ) đã đặc biệt quan tâm đến hoạt động nghiên cứu khoa học trong sinh viên (NCKH SV) nói chung, công tác tham gia Giải thưởng “Sinh viên nghiên cứu khoa học” cấp Bộ nói riêng. Nghiên cứu khoa học không chỉ giúp sinh viên bước đầu rèn luyện và nâng cao khả năng tư duy, tự khám phá, tự bồi dưỡng kiến thức khi còn ngồi trên ghế nhà trường mà còn giúp người học hình thành kỹ năng xác định đề tài, giới hạn phạm vi, lựa chọn phương pháp nghiên cứu. Điều này có nghĩa là NCKH SV được hình thành và phát triển trong quá trình đào tạo và ngược lại, nó cũng có tác động tích cực, giúp nâng cao hiệu quả, chất lượng của công tác dạy-học.

Trong tháng 1-2010, Hội đồng nghiệm thu đề tài NCKH cấp cơ sở đã tiến hành nghiệm thu và thông qua 3 đề tài cấp cơ sở sau:

Ngày 16/3/2012, Phó Hiệu trưởng Nguyễn Thị Cúc Phương đã ký Thông báo số 308/TB-ĐHHN về việc tổ chức Hội thảo khoa học quốc gia "Nghiên cứu và đề xuất hướng sử dụng Khung tham chiếu chung Châu Âu về ngôn ngữ (CEFR) cho đào tạo tiếng Anh tại Việt Nam".